Reliability of genomic prediction for milk fatty acid composition by using a multi-population reference and incorporating GWAS results

Table 3 Genomic prediction reliabilities obtained with traditional GBLUP based on within- and combined-population references

Trait	CN		DK		NL
Trait	Single	Combined	Single	Combined	Single	Combined
C8:0	0.06	0.05	0.06	0.26	0.11	0.18
C10:0	0.003	0.07	0.06	0.29	0.17	0.28
C12:0	0.001	0.04	0.04	0.18	0.25	0.31
C14:0	0.0004	0.001	0.11	0.11	0.25	0.36
C15:0	0.03	0.03	0.04	0.19	0.03	0.06
C16:0	0.19	0.18	0.001	0.07	0.13	0.19
C18:0	0.19	0.12	0.06	0.07	0.05	0.06
C14:1	0.11	0.15	0.06	0.16	0.39	0.49
C16:1	0.07	0.12	0.09	0.14	0.22	0.39
C18:1c9	0.07	0.15	0.005	0.09	0.13	0.26
C18:2n6	0.06	0.10	0.01	0.03	0.10	0.22
C18:3n3	0.08	0.04	0.10	0.01	0.06	0.21
CLA	0.12	0.10	0.14	0.16	0.16	0.25
C14 index	0.10	0.16	0.05	0.18	0.43	0.56
C16 index	0.10	0.13	0.09	0.14	0.12	0.30
C18 index	0.15	0.05	0.02	0.15	0.12	0.19

ISSN: 1297-9686