Skip to main content

Table 3 Estimates of SNP-based genetic parameters and percentage of additive genetic variance of backfat thickness explained by the significant genomic regions in each line

From: Genetic architecture and major genes for backfat thickness in pig lines of diverse genetic backgrounds

SNP-based genetic parameters A B C D E F G H
Heritability 0.52 0.51 0.58 0.30 0.53 0.50 0.36 0.54
Additive genetic variance, mm2 1.65 2.20 3.41 0.94 1.35 1.47 0.43 2.50
Additive genetic variance by genomic region, %
SSC Position, Mb  
 1 50.67–54.63 1.10 0.52 3.17a 0.22 0.97 0.10 0.77 0.98
 1 151.60–157.80 0.11 1.23 0.12 0.08 0.14 0.09 0.15 0.41
 1 157.81–162.85 1.85 3.34 5.33 0.54 0.07 0.05 0.18 1.24
 1 162.86–165.33 0.09 0.12 0.24 0.08 0.06 0.05 0.06 0.06
 1 268.68–271.74 8.02 0.15 0.27 0.33 0.49 0.26 0.21 0.27
 2 0.00–4.82 0.27 0.39 6.71 1.07 0.35 0.31 0.21 0.22
 2 60.14–67.56 0.04 0.12 0.04 0.13 0.48 0.11 0.11 0.13
 2 67.57–77.41 0.29 0.17 0.12 0.13 0.62 0.10 0.20 0.20
 5 18.18–20.32 0.12 0.13 0.17 0.14 0.95 0.13 0.10 0.16
 5 64.80–67.66 0.93 2.10 0.10 1.56 0.25 0.27 0.32 0.30
 5 67.67–69.90 0.07 0.21 0.06 0.34 0.06 0.05 0.07 0.11
 6 47.11–48.11 0.05 0.13 0.03 0.05 0.08 0.06 0.03 0.05
 6 146.99–147.99 0.07 0.45 0.49 0.07 0.10 0.02 0.07 0.08
 7 29.60–31.39 0.31 0.36 1.08 0.04 0.46 0.57 0.13 0.93
 7 31.40–32.49 0.04 0.21 0.09 0.02 0.12 0.04 0.07 0.05
 11 6.53–10.07 0.37 1.60 0.84 0.23 2.04 0.32 0.13 4.25
 12 24.85–25.87 0.19 0.05 0.06 0.07 0.05 0.05 0.07 0.05
 15 103.57–105.40 0.40 0.04 0.03 0.30 0.05 0.01 0.37 0.01
 15 118.63–119.63 0.07 0.25 0.13 0.07 0.05 0.26 0.02 0.05
 16 32.99–33.99 0.09 0.06 0.14 0.07 0.05 0.07 0.06 0.06
 18 7.82–12.28 0.28 0.86 0.24 0.28 0.19 0.29 0.08 1.23
 18 12.29–13.60 0.11 0.07 0.05 0.12 0.05 0.03 0.00 0.08
Remainder 85.13 87.46 80.48 94.05 92.33 96.77 96.58 89.08
  1. aItalic type indicates a significant association of the genomic region found in the GWAS with data from that line