Skip to main content

Table 3 Estimates of SNP-based genetic parameters and percentage of additive genetic variance of backfat thickness explained by the significant genomic regions in each line

From: Genetic architecture and major genes for backfat thickness in pig lines of diverse genetic backgrounds

SNP-based genetic parameters

A

B

C

D

E

F

G

H

Heritability

0.52

0.51

0.58

0.30

0.53

0.50

0.36

0.54

Additive genetic variance, mm2

1.65

2.20

3.41

0.94

1.35

1.47

0.43

2.50

Additive genetic variance by genomic region, %

SSC

Position, Mb

 

 1

50.67–54.63

1.10

0.52

3.17a

0.22

0.97

0.10

0.77

0.98

 1

151.60–157.80

0.11

1.23

0.12

0.08

0.14

0.09

0.15

0.41

 1

157.81–162.85

1.85

3.34

5.33

0.54

0.07

0.05

0.18

1.24

 1

162.86–165.33

0.09

0.12

0.24

0.08

0.06

0.05

0.06

0.06

 1

268.68–271.74

8.02

0.15

0.27

0.33

0.49

0.26

0.21

0.27

 2

0.00–4.82

0.27

0.39

6.71

1.07

0.35

0.31

0.21

0.22

 2

60.14–67.56

0.04

0.12

0.04

0.13

0.48

0.11

0.11

0.13

 2

67.57–77.41

0.29

0.17

0.12

0.13

0.62

0.10

0.20

0.20

 5

18.18–20.32

0.12

0.13

0.17

0.14

0.95

0.13

0.10

0.16

 5

64.80–67.66

0.93

2.10

0.10

1.56

0.25

0.27

0.32

0.30

 5

67.67–69.90

0.07

0.21

0.06

0.34

0.06

0.05

0.07

0.11

 6

47.11–48.11

0.05

0.13

0.03

0.05

0.08

0.06

0.03

0.05

 6

146.99–147.99

0.07

0.45

0.49

0.07

0.10

0.02

0.07

0.08

 7

29.60–31.39

0.31

0.36

1.08

0.04

0.46

0.57

0.13

0.93

 7

31.40–32.49

0.04

0.21

0.09

0.02

0.12

0.04

0.07

0.05

 11

6.53–10.07

0.37

1.60

0.84

0.23

2.04

0.32

0.13

4.25

 12

24.85–25.87

0.19

0.05

0.06

0.07

0.05

0.05

0.07

0.05

 15

103.57–105.40

0.40

0.04

0.03

0.30

0.05

0.01

0.37

0.01

 15

118.63–119.63

0.07

0.25

0.13

0.07

0.05

0.26

0.02

0.05

 16

32.99–33.99

0.09

0.06

0.14

0.07

0.05

0.07

0.06

0.06

 18

7.82–12.28

0.28

0.86

0.24

0.28

0.19

0.29

0.08

1.23

 18

12.29–13.60

0.11

0.07

0.05

0.12

0.05

0.03

0.00

0.08

Remainder

85.13

87.46

80.48

94.05

92.33

96.77

96.58

89.08

  1. aItalic type indicates a significant association of the genomic region found in the GWAS with data from that line