Genetic markers associated with bone composition in Rhode Island Red laying hens

Sallam, Moh; Wilson, Peter W.; Andersson, Björn; Schmutz, Matthias; Benavides, Cristina; Dominguez‑Gasca, Nazaret; Sanchez‑Rodriguez, Estefania; Rodriguez‑Navarro, Alejandro B.; Dunn, Ian C.; De Koning, Dirk‑Jan; Johnsson, Martin

doi:10.1186/s12711-023-00818-x

Genetics Selection Evolution

Table 4 Estimate of additive genetic variance (diagonal), genetic correlation (below diagonal) with standard errors, in addition to the partial phenotypic correlations (above diagonal), for FTIR traits

From: Genetic markers associated with bone composition in Rhode Island Red laying hens

	Tibia density	Tibia breaking strain	CT PO4/Amide I	CT CO3/PO4	CT CO3/Amide I	CT CO3 1450/1415	CT collagen maturity	CT lipid	MD PO4/Amide I	MD CO3/PO4	MD CO3/Amide I	MD CO3 1450/1415	MD collagen maturity	MD lipid
Tibia density	0.44 ± 0.06	0.67	− 0.17	0.26	0.01	− 0.17	− 0.17	− 0.32	0.13	− 0.02	0.21	− 0.12	− 0.05	− 0.09
Tibia breaking strain	0.33 ± 0.05	0.42 ± 0.06	− 0.19	0.25	− 0.04	− 0.16	− 0.19	− 0.32	0.14	− 0.05	0.21	− 0.08	− 0.08	− 0.07
CT PO4/Amide I	− 0.14 ± 0.04	− 0.11 ± 0.04	0.12 ± 0.05	− 0.86	0.8	− 0.29	0.27	0.39	0	− 0.05	− 0.04	0.05	0.15	0.08
CT CO3/PO4	0.18 ± 0.04	0.13 ± 0.04	− 0.11 ± 0.05	0.11 ± 0.05	− 0.42	0.12	− 0.24	− 0.29	0.07	0.01	0.11	− 0.08	− 0.12	− 0.08
CT CO3/Amide I	− 0.05 ± 0.04	− 0.04 ± 0.04	0.10 ± 0.05	− 0.06 ± 0.04	0.11 ± 0.05	− 0.44	0.24	0.32	0.1	− 0.09	0.06	0	0.14	0.05
CT CO3 1450/1415	− 0.07 ± 0.04	− 0.06 ± 0.04	0.01 ± 0.03	− 0.04 ± 0.03	− 0.03 ± 0.04	0.08 ± 0.04	0.09	0.24	− 0.13	0.07	− 0.15	0.02	− 0.09	− 0.02
CT collagen maturity	− 0.08 ± 0.04	− 0.10 ± 0.04	0.05 ± 0.04	− 0.05 ± 0.03	0.03 ± 0.03	0.04 ± 0.04	0.10 ± 0.04	0.53	0.01	− 0.03	− 0.03	− 0.07	0.07	− 0.07
CT lipid	− 0.20 ± 0.04	− 0.19 ± 0.04	0.14 ± 0.04	− 0.13 ± 0.04	0.09 ± 0.04	0.06 ± 0.04	0.10 ± 0.04	0.20 ± 0.05	0.01	− 0.02	− 0.08	0.08	0.09	0.1
MD PO4/Amide I	0.08 ± 0.04	0.11 ± 0.04	− 0.04 ± 0.03	0.05 ± 0.03	− 0.01 ± 0.03	− 0.01 ± 0.03	− 0.01 ± 0.03	− 0.06 ± 0.04	0.06 ± 0.03	− 0.59	0.82	− 0.22	− 0.11	− 0.07
MD CO3/PO4	− 0.04 ± 0.04	− 0.05 ± 0.04	0.00 ± 0.03	− 0.01 ± 0.03	− 0.01 ± 0.04	0.00 ± 0.03	0.00 ± 0.04	0.01 ± 0.04	− 0.05 ± 0.03	0.07 ± 0.05	− 0.27	0	0	− 0.17
MD CO3/Amide I	0.13 ± 0.04	0.15 ± 0.04	− 0.06 ± 0.03	0.07 ± 0.03	− 0.02 ± 0.03	− 0.02 ± 0.03	− 0.04 ± 0.03	− 0.09 ± 0.03	0.07 ± 0.03	− 0.03 ± 0.03	0.09 ± 0.03	− 0.36	− 0.18	− 0.31
MD CO3 1450/1415	− 0.05 ± 0.04	− 0.06 ± 0.04	0.01 ± 0.04	− 0.01 ± 0.03	− 0.01 ± 0.04	0.03 ± 0.04	0.01 ± 0.04	0.04 ± 0.04	− 0.03 ± 0.04	0.03 ± 0.04	− 0.03 ± 0.03	0.05 ± 0.05	0.09	0.74
MD collagen maturity	− 0.02 ± 0.04	− 0.02 ± 0.04	0.04 ± 0.03	− 0.02 ± 0.03	0.03 ± 0.03	0.00 ± 0.03	0.05 ± 0.03	0.04 ± 0.04	0.00 ± 0.03	0.02 ± 0.03	− 0.01 ± 0.03	0.01 ± 0.03	0.08 ± 0.05	0.12
MD lipid	− 0.02 ± 0.03	− 0.04 ± 0.03	0.02 ± 0.04	− 0.02 ± 0.03	0.01 ± 0.04	0.02 ± 0.04	0.02 ± 0.03	0.04 ± 0.04	− 0.01 ± 0.04	0.00 ± 0.04	− 0.02 ± 0.02	0.02 ± 0.05	0.01 ± 0.02	0.03 ± 0.06

FTIR: Fourier transform infrared spectroscopy; CT: cortical bone; MD: medullary bone; OM: organic matter
Genetic correlations are estimated by multi-trait genomic restricted maximum likelihood; partial phenotypic correlations: phenotypes (adjusted for body weight) correlations

Back to article page

ISSN: 1297-9686

Contact us

Submission enquiries: gse@inrae.fr
General enquiries: info@biomedcentral.com